Funeducar ofrece acompañamiento para facilitar los procesos de enseñanza-aprendizaje para el desarrollo educativo. Los maestros de los colegios cristianos son instruidos para desarrollar habilidades a fin de integrar la Biblia en todas las asignaturas del currículo y en el quehacer pedagógico escolar en general, dentro y fuera del aula. De la misma manera ofrece acompañamiento para el personal administrativo. Para llevar adelante esta misión, Funeducar se apoya en la oferta de ministerios afines que ofrecen certificación en Cosmovisión Bíblica; Integración Bíblica en el Currículo;, principios Bíblicos y Cristocéntricos de la Educación, la Familia y el Gobierno; Evangelismo y Discipulado de Infantes de niños y niñas;